Het beste zou zijn gewoon een volledige backup van je VPS Server te maken, mocht er wat mis gaan heb je altijd een volledige backup die je kan terug zetten en zo met een schone installatie van Centos6.5 kan beginnen.

Hallo,

Mijn voorkeur is even een 2de vps kopen en daarop clean alles opnieuw installeren.
Dan alle sites overzetten via directadmin (backup exporteren en dan terug importeren) en klaar.
Noot: je moet dan wel het ip kunnen veranderen tijdelijk van je directadmin installatie voor de licentie.

Als het toch op dezelfde vps gaat:
1) Maak een snapshot van je vps voor de update
2) Maak in directadmin een backup van al je sites naar een externe locatie
3) Als je wijzigingen hebt gemaakt in je configs, maak je hier ook een backup van. Bv backup de map /etc
4) Als je extra tools hebt geinstalleerd, zoals firewall, ... backup schrijf op welke, zodat je dit nadien terug kan installeren. De configs hiervan zie stap 3.
5) Installeer een cleane versie van Centos 6
6) Installeer Directadmin, met custombuild 2 de laatste versies van alles. (Ik adviseer ook nginx, maar dan riskeer je meer dat de sites wijzigingen nodig hebben, bv de .htaccess bestanden)
7) Importeer de backups terug
Test alle sites grondig en hou de php error logs in de gaten!

Klaar